Kaji Ryoji, Aida Kensuke cùng đội tình báo của Nerv Nhật Bản đang ở một nơi xa xôi, tận hòn đảo Síp phía đông Địa Trung Hải.
Dấu vết Seele để lại đã bất ngờ dẫn họ đến hòn đảo này.
Kế hoạch Đồng hóa Nhân loại đã thất bại. Cứ cho rằng đó là một điều tốt đi chăng nữa, thì loài người vẫn cần phải tìm ra ý nghĩa đằng sau thông điệp của Armaros và mục đích ban đầu của Kế hoạch là gì. Để tìm kiếm câu trả lời, Kaji và Kensuke đang lần theo những tri thức mà đám lão già đeo kính che mặt kia để lại. Các Cuộn sách Biển Chết, vốn là một nguồn giải đáp đáng tin cậy, giờ đây cũng chẳng cho thêm được mấy thông tin sau khi Kế hoạch đổ vỡ.
Đội của Kaji đang điều tra tầng hầm của một nhà thờ cổ trong một ngôi làng bị bỏ hoang. Xung quanh họ, người dân Síp đang chìm trong xung đột. Hai phe, một ở phía bắc và một ở phía nam, đang tranh giành lãnh thổ, và đường ranh giới ngừng bắn của Liên Hợp Quốc cứ nhảy múa liên hồi — lúc tiến về phía bắc, lúc lùi về phía nam, rồi lại quay ngược trở lại. Ngôi làng này chỉ mới bị chiếm đóng vài ngày trước.
「Nói thẳng ra thì,」 Kensuke nói, 「chúng ta chẳng khác gì mấy tên trộm mộ, phải không?」
Giữa lúc châu Âu đang hỗn loạn, Kensuke đã lần ra được một manh mối, dù rất mong manh, rằng Seele từng có một căn cứ ở đây — dù từ mà người cung cấp thông tin đã dùng là 「sào huyệt」.
Sào huyệt à, Kaji thầm nghĩ rồi bật cười. Gì chứ, nghe như một tổ chức tội ác nào đó vậy?
Nhà thờ này có liên hệ với Dòng tu Malta. Bằng cách chọn địa điểm này, có lẽ Seele đã có ý định ẩn mình sau những huyền thoại về một tổ chức bí mật khác.
Tầng hầm của nhà thờ từng được chính phủ hoặc quân nổi dậy sử dụng để chứa đạn dược. Đạn dược gỉ sét bị vứt thành từng đống khắp không gian.
Trong lúc điều tra một bức tường bị che khuất sau một đống như vậy, Kensuke thông báo: 「Có một gian phòng trống ở phía bên kia bức tường này.」
「Này này, cậu trai trẻ,」 Kaji nói. 「Cậu có nghĩ đến việc cái máy quét siêu âm đó có thể kích nổ đám vật liệu chưa nổ này không đấy?」
Kensuke phá lên cười tự mãn. 「Kaji-san, sao anh lại có thái độ đó khi chúng ta sắp khám phá ra một thánh tích — hoặc ít nhất, một thứ được cất giấu kỹ lưỡng như thể nó là một thánh tích chứ?」
Bức tường có một cánh cửa ẩn, và hai người đã xoay xở cạy được nó ra sau một hồi loay hoay. Họ đã nghĩ sẽ tìm thấy một không gian tối đen như mực, nhưng hẳn là phải có một lỗ hổng nào đó trên trần đá, bởi một luồng sáng đang chiếu rọi xuống chiếc bàn đá ở trung tâm căn phòng.
Và trên bàn, là... Chà, chà.
「Đó là kính che mặt của Kiel,」 Kaji nói, mắt liếc quanh tìm kiếm dấu hiệu của bất kỳ loại bẫy nào. 「Dù đây có phải là sào huyệt của chúng hay không, thì Seele chắc chắn đã từng ghé qua nơi này.」
Ai đã mang — hay trả — chiếc kính này về đây? Dù thế nào đi nữa, đây cũng là một manh mối.
Kaji ngẫm nghĩ, ngân nga một tiếng. 「Thôi được rồi, bắt tay vào việc nào.」
Năm giờ sau, họ vẫn không tìm thấy thêm bất cứ thứ gì đáng kể. Sau khi đã cạn kiệt mọi ý tưởng khác, Kensuke đang dùng máy quét của mình trên chiếc kính, còn Kaji thì gõ dọc theo các bức tường.
「Chiếc kính này trông như có một loại cổng dữ liệu nào đó,」 Kensuke nói, 「nhưng nó kỳ lạ lắm...」
「Kỳ lạ chỗ nào?」
「Không có bộ nhớ lưu trữ hay thiết bị liên lạc... thậm chí cả nguồn năng lượng cũng không. Chỉ có một cổng xuất tín hiệu.」
Kaji ngửa một bàn tay lên. 「Chắc là cậu cần kết nối nó với một thiết bị khác để lấy hình ảnh hoặc âm thanh hay gì đó.」
「Khi không có bất kỳ cổng nhập tín hiệu hay ăng-ten nào ư?」
「Biết đâu nó dùng cảm ứng hay gì đó...」
「Kaji-san, nhìn kìa!」
Kensuke chỉ vào chiếc bàn đá, nơi chiếc kính bắt đầu nhòe đi như thể nó là một hình ảnh trên màn hình. Nó đang mờ dần theo kiểu nhiễu sóng như thể sắp tan biến khỏi sự tồn tại.
「Vô lý!」 Kaji nói. Anh cầm chiếc kính lên tay. May thay, anh thấy mình vẫn có thể chạm vào nó. Nhưng ngay cả trong tay anh, chiếc kính vẫn tiếp tục nhấp nháy.
Chiếc kính đang biến mất, Kaji nghĩ. Và trước khi nó biến mất, chỉ có một việc chúng ta có thể làm...
Kensuke cũng đi đến kết luận tương tự. 「Kaji-san, để em thử đeo nó.」
「Anh không chắc đó là một ý hay đâu. Thứ này không bình thường.」
「Em muốn biết tất cả mọi thứ!」
Ánh mắt Kensuke vô cùng nghiêm túc. Dù gì đi nữa, cậu chính là người đã khám phá ra nơi này.
Cậu ta đã trả giá gì để có được thông tin này? Kaji tự hỏi.
Ngay trước khi đội của Kaji mất liên lạc với Nerv Nhật Bản, họ đã nhận được tin rằng một chiếc Eva-02 màu trắng của Đức đã xuất hiện, với đôi cánh giống một cách đáng kinh ngạc với Allegorica.
Không có hồ sơ nào cho thấy Nerv Nhật Bản từng cử một đội khảo sát đến khu vực này. Tuy nhiên, trước khi Nerv chia rẽ, mỗi chi nhánh đều chịu trách nhiệm tích cực điều tra các địa điểm khảo cổ có khả năng liên quan đến các di vật. Và Síp hẳn sẽ thuộc thẩm quyền của chi nhánh châu Âu...
Tâm trí Kaji ghép nối các mảnh ghép lại với nhau.
Cậu ta đã giao dịch với người châu Âu.
Cậu ta đã từ bỏ công nghệ của Allegorica để đổi lấy chiếc kính này.
Cậu ta đã đi quá xa rồi.
Việc không được chọn làm phi công Eva hẳn đã là một cú sốc lớn đối với Aida Kensuke thời trẻ. Cậu đã vứt bỏ mọi thứ — các mối quan hệ, gia đình, nhà cửa, bạn bè — và cống hiến hết mình cho cục tình báo, hoàn thành các nhiệm vụ với một sự hăng hái đáng kinh ngạc bất kể tính hợp pháp của chúng.
Có lẽ để cậu ta ở gần mình là một sai lầm, Kaji nghĩ.
Kaji không lạ gì việc đưa ra những quyết định cực đoan. Anh chưa bao giờ nhìn nhận bản thân qua lăng kính thiện hay ác; anh chỉ đơn thuần là di chuyển các quân cờ. Đó có phải là những gì Kensuke đã làm không?
Mình cá là cậu ta cũng đang cảm thấy cái cảm giác thượng đẳng đó.
Kaji cảm thấy như thể anh đang nhìn vào chính mình trong quá khứ.
Nhưng cái giá phải trả là gì, và nó sẽ được trả như thế nào?
「Này—」 Kensuke phản đối, khi Kaji đeo chiếc kính lên.
Thông tin tràn vào tâm trí anh — ánh sáng, âm thanh, và một thứ gì đó không xác định, vượt ngoài ngũ quan của anh — ghi đè lên những gì đã có sẵn.
Đây là cái gì? Đây là loại công nghệ gì?
Câu trả lời đến ngay lập tức.
Chiếc kính chứa đựng một tập hợp ký ức, được mang theo qua vòng quay của thời gian, để ngăn người đeo lặp lại những sai lầm tương tự sau khi mọi thứ bắt đầu lại từ con số không.
Quá muộn, Kaji nhận ra mình đã phạm một sai lầm khủng khiếp, và thế nhưng... điều đó cũng không hoàn toàn bất ngờ.
「Anh đoán đây là lúc mình nên nói, ‘tội nghiệp cho tôi’,」 Kaji nói. Đó là những lời cuối cùng anh tự mình thốt ra.
Kiến thức tích lũy của Seele trong quá khứ — dù nó không phải lúc nào cũng được gọi bằng cái tên đó — đã ghi đè lên anh. Hoặc... là nó đang hòa trộn với anh? Quá khứ? Quá khứ là gì? Anh có rất nhiều câu hỏi, nhưng hiểu rằng câu trả lời đều ở xung quanh mình. Anh biết Seele đã được truyền lại như thế nào. Đến tận cùng, chỉ có thứ quan trọng nhất đối với anh còn sót lại — tình yêu của anh, Misato. Rồi hình ảnh của cô chìm xuống và biến mất.
Anh xin lỗi.
Seele là người quản gia của Kế hoạch Đồng hóa Nhân loại.
Nhưng Kế hoạch đã được phó thác cho thế giới tiếp theo, một thế giới chưa được sinh ra, và khi không còn gì ngoài việc chờ đợi sự kết thúc, Seele không còn bất kỳ mục đích nào nữa.
Trong thế giới đang tàn lụi này, Kaji Ryoji đã trở thành Seele mới.